Über das Projekt
Das Hauptziel des bereits abgeschlossenen Projekts RACOON-COMBINE war die Entwicklung und Umsetzung einer Pipeline für die Extraktion COVID-spezifischer, prädiktiver und prognostischer quantitativer Bildgebungs-Biomarker (C-QIBs), um eine umfassende Phänotypisierung nicht nur der Erkrankung, sondern auch des Erkrankten, also seines körperlichen Zustands und seiner Begleiterkrankungen zu ermöglichen. Die prädiktiven und prognostischen Informationen, die die C-QIBs liefern, werden nicht nur die Behandlung der Patient:innen verbessern (d.h. individualisieren), sondern auch unser Verständnis der verschiedenen COVID-19-Krankheitsmuster sowie den krankheitsspezifischen Organ-Crosstalk verbessern.
Das wichtigste im Überblick
Dieses Projekt war der erste Use Case der RACOON-Infrastruktur und folgte dem selben integrativen, partizipativen und synergetischen Konzept, das für RACOON charakteristisch ist. RACOON-COMBINE vereinte alle 38 NUM-Partnerstandorte und baute auf der etablierten RACOON-Infrastruktur auf. RACOON-COMBINE sah zunächst vor, den aktuellen Bestand an verfügbaren Bilddaten aller Partnerstandorte zu erweitern. Darüber hinaus wurden zusätzliche Thorax-Bilddatensätze eingeschlossen, die seit der ersten COVID-19-Infektionswelle gewonnen wurden. Daneben wurden als Neuerung gegenüber RACOON pädiatrische Bildgebung, Neurobildgebung und kardiovaskuläre Bildgebung mit eingeschlossen. Auf dieser erweiterten Datenbasis wurden bildgebende Biomarker (IB) ausgewählt, die a) für die Einstufung der individuellen COVID-19-Krankheitslast (Spektrum und Schweregrad des Organbefalls) wesentlich sind und b) die vorbestehende metabolische, kardiovaskuläre und pulmonale Gesundheit des einzelnen Patienten widerspiegeln. Schließlich wurden COVID-spezifische Bildgebungsmerkmale bezüglich ihres prädiktiven Werts für das Outcome der Patient:innen untersucht. Es wurden statistische und maschinelle Modelle für die individuelle Krankheitsvorhersage und -prognose trainiert. In der letzten Projektphase wurden standardisierte Arbeitsabläufe für die automatische und manuelle Extraktion relevanter C-QIBs auf allen RACOON-Knotenpunkten ausgerollt.